Очевидно, что "Коней", "Купола", "Райские яблоки", "SOS" и т.п. ВВ тоже считал своими главными, особенными песнями, однако прямо об этом вроде не говорил. Поэтому возникает вопрос, что значит "главная" песня? По глубине? Сам автор различал гениальность своих песен

А вот частота исполнений на выступлениях зависит немного от другого. Тут элемент "попсовости" сказывается, т.е. "формата" и "не формата".
Ещё надо учитывать, что ВВ был, как выразился кто-то, "первым русским рокером"

Ему нравился ритм и заряд своих песен. Например, песня "Я не люблю", на мой вкус, какой-то особой философской глубины не содержит, но имеет "магию" в исполнении на гитаре, подкупая ритмом и точностью соответствия простых слов простым аккордам. Почему-то хочется исполнять на гитаре её снова и снова, хотя вроде простой набор "тезисов"...
"Бег иноходца" тоже берёт, на мой взгляд, больше ритмом и невероятной энергией. Исполнять эту песню в мощном темпе - одно удовольствие. Вот ВВ это удовольствие и получал

Сюда же отнесу "Братские могилы". Здесь тоже посмею сказать, что большая частота исполнения этой песни вызвана не столько уровнем поэзии самой по себе, сколько удачным сплавом текста и музыки, соответствием текста звуку (мелодии). Там каждое слово мастерски ложится именно на свой аккорд, и одновременно, можно варьировать мелодию в мелких нюансах (из десятков исполнений этой песни очень мало абсолютно одинаковых вариантов в расстановке аккордов).
Тыщу раз ИМХО.